Se cuenta que un huevo habitó en el centro de la nada, cuando aún no existía el universo. Al eclosionar, nació de él Arceus, considerado el Pokémon creador, ya que creó todo lo existente.
Lo primero que hizo, fue crear a Mew para que velase por el universo, por lo que éste y Arceus son los Pokémon que vieron todo el proceso de formación del cosmos.
Tuvo que crear después a Dialga y Palkia para controlar el tiempo y el espacio.. Después Arceus creó a Giratina como mediador para detener las luchas entre éstos dos.
Posteriormente creó a Jirachi que estableció las estrellas y el firmamento, aunque más tarde éste también quiso conceder a personas y Pokémon, sus afables deseos si el cometa milenario es visto por humanos en el cielo nocturno. Una vez creada la luz gracias a Jirachi, al instante se pudo ver a Darkrai de la sombra de Arceus. Arceus pensó dar al universo que estaba creando un toque místico, por lo que creó a Cresselia, el cual fue el primer Pokémon con sentimientos como la compasión, afecto, piedad, ternura, dolor, tristeza, delicadeza, pasión, etc. Éste, debido a sus sentimientos, deseó tener ayuda y compañía, por lo que creó el trío legendario formado por Uxie, Mesprit y Azelf. Este trío legendario se encargaría más tarde de dotar a los seres vivos de sentimientos como la emoción, sabiduría y voluntad, características básicas que representan a cada uno de ellos, respectivamente. Darkrai nació justo cuando Arceus nació, casi al momento, pero no se dejó ver hasta que la luz fue creada.
Groudon creó los continentes, Kyogre los océanos, y Rayquaza el cielo. Después, Regigigas organizó la Tierra, arrastrando con gigantescas cadenas los continentes, pero luego fue congelado de tal manera que solo se despertará cuando los tres Regis (Regirock, Registeel y Regice) estén frente a él y lo "invoquen" en el caso de que la Tierra esté en peligro estos tres regis fueron creados con el fin de ayudar a Regigigas en su misión. Inmediatamente con la aparición de estos tres Pokémon aparecieron, respectivamente, los elementos roca, hielo y metal.
Arceus había ayudado a Regigigas creando a Kyogre, Groudon y Rayquaza para crear los océanos, la tierra y el cielo, respectivamente. Dado que la Tierra es limitada, cuando se llenó entre océanos y tierra ya no quedaba más espacio, Groudon y Kyogre se pelearon por conquistar el Planeta. Como esos dos Pokémon eran fortísimos, y podían llegar a destruir el planeta, Regigigas estaba a punto de acudir para pararles; pero Rayquaza, el más poderoso de los tres y dueño de los cielos, decidió solucionar el conflicto él mismo, soltanto un grito agudísimo que calmó a los combatientes, dejándole a Groudon parte de su territorio en el cielo para crear montañas enormes y así solucionar el problema. Posteriormente, Arceus creo a Manaphy para cuidar a los Pokémon del tipo agua, ya que el mar es la fuente de la vida orgánica y microscópica, de la cual nacerían y evolucionarían posteriormente más Pokémon y los mismos humanos, que a su vez crearían a Mewtwo como un experimento. Como ayuda en esta difícil tarea, Manaphy y Phione aparecieron cada uno con el fin de salvaguardar las aguas frías y aguas cálidas del mundo. Arceus les dió como obsequio a los humanos a Latios y Latias para que buscasen a personas de buen corazón y protegerlas de las catástrofes naturales, en vista de la maldad existente entre los humanos, que ni él mismo podía controlar directamente.
Más tarde, Arceus creó a Solgaleo y a Lunala, que son la representación viva del Sol y la Luna en la Tierra. Posteriormente creó a Ho-oh Pokémon de la torre Quemada,en la región Johto y que dio vida a los tres perros legendarios: Raikou el creador del rayo, Entei el creador y portador del fuego a los humanos y Suicune el purificador del agua y los Pokémon. Después creó a los Pokémon controladores del aire: a las tres aves legendarias con Articuno el ave controlador del frío, Zapdos el ave controlador del trueno y Moltres el ave controlador del calor y el fuego.. y tras la creación de estas aves aparecería Lugia Pokémon legendario habitante de las profundidades marinas para poner fin a los conflictos entre estas aves legendarias. Así que Ho-Oh encerró a los tres perros en una torre que creó usando su más funesto ataque Fuego Sagrado (Se le llamó Torre Quemada) De ese ataque, una parte salió volando a altas velocidades y llegó a Sinnoh.Llegó a un volcán y al mezclarse con los metales de la tierra surgió Heatran, que se le encomendó el cargo de "encender" los volcanes cercanos cuando un humano hacía algo que no debía y podía causar destrozos. Lugia por otro lado se encargó de las aves, saliendo de un torbellino desde las profundidades marinas y, al igual que Rayquaza: con su canto calmó a las aves, que se marcharon a Kanto y habitaron en los lugares más adecuados a su clima. Lugia se marchó a las profundidades marinas por el mismo torbellino del que salió y dejó a los humanos un instrumento musical con el que se puede invocarle para parar la lucha de las tres aves en caso de necesitarlo en el futuro. Ese lugar se conoce hoy en día como las Islas Remolino.
Luego de eso, Arceus creó a Celebi con el don de viajar en el tiempo para que creara las estaciones del año, cuidando y guardando así la naturaleza que Shaymin creó. Shaymin y Celebi son un complemento ya que respectivamente uno creó la naturaleza y el otro la mantiene en vida. Después, Celebi con la ayuda de los otros Pokémon legendarios crearon a otros muchos de los Pokémon que rigen la existencia de ecosistemas y la supervivencia de ellos mismos por medio de la cadena trófica. ¿Cómo? Darkrai intentó crear la vida pero le salió mal y creó a Giratina, la representación de la muerte. Sus poderes se concentraron tanto que se abrió una dimensión paralela llamada Mundo Distorsión, después Giratina aprendió a controlar sus poderes y se dice que pasa volando por las ciudades cerca de los lagos en Sinnoh. Celebi intentó después crear vida con éxito.
Cuando el universo se creó, Arceus separó la antimateria del universo y la trasladó a la parte más aislada del mismo. Esa antimateria fue alcanzada por un virus alienígena que vagaba por el espacio, y tras la exposición a unas extrañas radiaciones nació el Pokémon del espacio denominado Deoxys.
La leyenda continúa y cuenta que una vez creados los Pokémon y el universo, Arceus se traslado a un lugar llamado Sala del Origen, en lo más alto de unas ruinas del Monte Corona, descansando en su gran creación, y sólo saldrá cuando el universo corra grave peligro; peligro que Mew y los demás Pokémon creados para vagar por siempre por toda la Tierra y creados por Arceus con el fin de cuidarla, no sean capaces de solucionar. Arceus le gusta descansar en soledad, aislado de toda forma de vida, de espacio y de tiempo. También se dice que Arceus entiende todo tipo de idioma Pokémon y además el lenguaje humano. T una vez que descansaba vio que la tierra estaba en peligro porque Darkrai al crear a Girattina creó a Yveltal y Arceus creóal pokemon vida Xerneas para calmar a Yveltal.
Otras leyendas hablan sobre un misterioso objeto llamado Flauta azur, cuentan que tiene el poder de invocar unas escaleras de cristal a la Sala del Origen, seguramente hecha por alguna antiquísima civilización que ya conocía la Gran existencia del Pokemon llamado Arceus.
